Mars 1865. I USA, under borgerkrigen, flyktet fem våghals-nordlendinger for en ballong fra sørlendingene i Richmond. En forferdelig storm kaster fire av dem på bredden av en ubebodd øy på den sørlige halvkule. Den femte mannen og hunden hans gjemmer seg i havet utenfor kysten. Denne femte - en viss Cyres Smith, en talentfull ingeniør og vitenskapsmann, sjelen og lederen for en gruppe reisende - holder kameratene uforvarende i spenning i flere dager, som hverken finner ham eller hunden som er viet til ham. Den tidligere slaven lider mest av alt, og Smiths nå lojale tjener er negeren Nab. I ballongen satt også en krigsjournalist og Smiths venn, Gideon Spilet, en veldig energisk og avgjørende mann med et syvt sinn; matros Pencrof, en godmodig og eventyrlig våghals; Femten år gamle Harbert Brown, sønnen til kapteinen på skipet som Pencrof seilte på, forble en foreldreløs, og som sjømannen behandler som sin egen sønn. Etter et slitsomt søk finner Nab endelig sin uforklarlig frelste vert, en kilometer fra kysten. Hver av de nye nybyggerne på øya har uerstattelige talenter, og under ledelse av Cyres og Spilet stiller disse modige menneskene sammen og blir et samlet lag. Først, med hjelp av enkleste midler for hånden, og deretter produsere i sine egne små fabrikker mer og mer komplekse gjenstander av arbeidskraft og husholdningsvarer, utstyrer nybyggere livet. De jakter, samler spiselige planter, østers, og deretter til og med avler husdyr og driver med oppdrett. De ordner seg hus høyt i berget, i en hule frigjort for vann. Snart, takket være deres harde arbeid og intelligens, vet ikke lenger kolonistene behovet for mat, klær, varme og komfort. De har alt bortsett fra nyheter om hjemlandet, skjebnen de er veldig bekymret for.

En gang tilbake til huset deres, kalt Granite Palace, ser de at apekatter makker seg inne. Etter en tid, som under påvirkning av sinnssyk frykt, begynner apene å hoppe ut av vinduene, og noens hånd kaster repstigen som apene løftet inn i huset. Inni finner folk en annen ape - en orangutang, som de holder og kaller onkel Jupe. I fremtiden blir Jupe en venn, tjener og uunnværlig hjelper for mennesker.

På en annen dag finner nybyggere i sanden en boks med verktøy, skytevåpen, forskjellige apparater, klær, kjøkkenutstyr og bøker på engelsk. Nybyggere lurer på hvor denne boksen kunne komme fra. Fra kartet, som også dukket opp i boksen, finner de at ved siden av øya, på kartet som ikke er merket, er øya Tabor. Sjømannen Pencrof er ivrig etter å gå til ham. Ved hjelp av vennene bygger han en bot. Når boten er klar, drar de sammen for en testreise rundt øya. Under den finner de en flaske med en lapp som sier at den forlisete mannen venter på frelse på øya Tabor. Denne hendelsen styrker Pencroffs tillit til å besøke en naboøy. Pencrof, journalisten Gideon Spilet og Harbert seilte. Ved ankomst til Tabor oppdager de en liten hytte der det, etter alt å dømme, ingen har bodd på lenge. De sprer seg rundt øya, ikke i håp om å se en levende person, og prøver å finne minst hans levninger. Plutselig hører de Harbert skrike og skynde seg for å hjelpe ham. De ser Harbert slite med en slags apevoksen skapning. Apen viser seg imidlertid å være en vildtmann. Reisende binder ham og frakter ham til øya deres. De gir ham et eget rom i Granittpalasset. Takket være deres oppmerksomhet og bekymringer, blir vilde snart tilbake til en sivilisert mann og forteller dem sin historie. Det viser seg at navnet hans er Ayrton, han er en tidligere kriminell, han ønsket å ta besittelse av Duncan-seilskipet og ved hjelp av de samme drammene i samfunnet forvandlet han seg til et piratskip. Planene hans var imidlertid ikke bestemt til å gå i oppfyllelse, og som en straff for tolv år siden ble han igjen på den ubebodde øya Tabor, slik at han ville innse sin gjerning og soning for sin synd. Eieren av "Duncan" Eduard Glenarvan sa imidlertid at han en dag ville returnere for Ayrton. Nybyggerne ser at Ayrton oppriktig omvender seg fra synder fra tidligere, og han prøver å være nyttig for dem på alle måter. Derfor er de ikke tilbøyelige til å dømme ham for tidligere oppførsel og villig til å akseptere ham i deres samfunn. Ayrton trenger imidlertid tid, og derfor ber han om en mulighet til å leve i koraller som nybyggerne bygde for sine husdyr i et stykke fra Granittpalasset.

Da boten kom tilbake til stormen fra Tabor Island om natten, ble den reddet av et bål, som, som de trodde, flytende på den, ble tent av vennene deres. Det viser seg imidlertid at de ikke var involvert i dette. Det viser seg også at Ayrton ikke kastet en flaske lapp i sjøen. Nybyggere kan ikke forklare disse mystiske hendelsene. De er stadig mer tilbøyelige til ideen om at det, foruten dem, på øya Lincoln, mens de døpte ham, er det noen andre, deres mystiske velgjører, som ofte hjelper til i de vanskeligste situasjonene. De begir seg til og med på en søkekspedisjon i håp om å finne hjemstedet hans. Imidlertid ender søket til ingen nytte.

Neste sommer (siden det allerede var fem måneder siden Ayrton dukket opp på øya deres og til han fortalte dem historien sin og sommeren var over, og det er farlig å seile i den kalde årstiden), bestemmer de seg for å komme tilbake til Tabor Islands for å legge igjen en lapp i hytta. I notatet har de til hensikt å advare kaptein Glenarvan hvis han kommer tilbake at Ayrton og fem andre vrakede ofre venter på hjelp på en naboøy.

Nybyggere har bodd på øya i tre år. Deres liv, økonomien nådde velstand. De høster allerede rike hvetevekster dyrket fra et enkelt korn, som ble funnet i Harberts lomme for tre år siden, bygde en kvern, reiste fjærkre, utstyrte boligen sin fullstendig, laget nye varme klær og tepper til seg selv fra mouflonull. Imidlertid overskygges deres fredelige liv av en hendelse som truer dem med døden. En gang, når de ser på havet, ser de et velutstyrt skip i det fjerne, men et svart flagg flyr over skipet. Skipet anker utenfor kysten. Den viser vakre kanoner med lang rekkevidde. Ayrton sniker seg inn i skipet under tak om natten for å gjennomføre rekognosering. Det viser seg at det er femti pirater på skipet. Ayrton på mirakuløst vis glir bort fra dem, og kommer tilbake til kysten og forteller vennene sine at de trenger å forberede seg til slaget. Neste morgen stiger to båter fra skipet. På den første skyter nybyggerne tre av dem, og hun kommer tilbake, den andre lander på stranden, og de seks gjenværende piratene gjemmer seg i skogen. Kanonene er svidd fra skipet, og det kommer enda nærmere kysten. Det ser ut til at ingenting har makt til å redde en håndfull nybyggere. Plutselig bølger en enorm bølge under skipet, og den synker. Alle pirater på den dør. Som det viser seg senere, ble skipet sprengt av en gruve, og denne hendelsen overbeviser til slutt innbyggerne på øya om at de ikke er alene her.

Til å begynne med vil de ikke utrydde piratene, og ønsker å gi dem muligheten til å leve et fredelig liv. Men det viser seg at ranerne ikke er i stand til dette. De begynner å plyndre og brenne nybyggernes husstand. Ayrton drar til koraller for å besøke dyrene. Pirater griper ham og tar ham med til en hule, der de vil torturere ham for å gå med på å gå til deres side med tortur. Ayrton gir seg ikke. Vennene hans hjelper ham, men er alvorlig skadet i Harberts korall, og vennene hans forblir i ham uten å være i stand til å gå tilbake med den unge mannen som var døende. Etter noen dager drar de fremdeles til Granittpalasset. Som et resultat av overgangen begynner Harbert en ondartet feber, han er ved døden. Nok en gang griper forsyn inn i deres liv, og hånden til deres gode mystiske venn kaster dem den nødvendige medisinen. Harbert er i full bedring. Nybyggerne har til hensikt å levere det endelige støtet til piratene. De drar til koraller, der de har tenkt å finne dem, men finner Ayrton, som er utmattet og knapt i live, og i nærheten av røverne. Ayrton melder at han ikke vet hvordan han havnet i korallen, som brakte ham fra hulen og drepte piratene. Imidlertid melder han en trist nyhet. For en uke siden dro bandittene til sjøs, men uten å vite hvordan de skulle kontrollere boten, brøt den på kystrevene. Turen til Tabor må utsettes til bygging av et nytt kjøretøy. I løpet av de neste syv månedene gjør ikke den mystiske fremmed seg gjeldende. I mellomtiden våkner en vulkan på øya, som kolonistene trodde allerede var død. De bygger et nytt stort skip, som om nødvendig kan levere dem til bebodd land.

En kveld, allerede klar til å legge seg, hører innbyggerne i Granittpalasset en bjelle. Telegrafen som de brukte fra koraller til hjemmet fungerer. De blir raskt innkalt til koraller. Der finner de en lapp som ber dem gå langs den ekstra ledningen. Kabelen fører dem til en enorm grotte der de til deres forbauselse ser en ubåt. I den møter de sin herre og deres skytshelgen, kaptein Nemo, den indiske prinsen Dakkar, som har kjempet for uavhengigheten av hjemlandet hele livet. Han, allerede en seksti år gammel mann som begravde alle sine medarbeidere, er i nærheten av døden. Nemo gir nye venner en kiste med juveler og advarer om at når vulkanen utbryter, vil øya (slik er dens struktur) eksplodere. Han dør, nybyggerne skruer opp luken på båten og senker den under vannet, og de bygger det nye skipet utrettelig hele dagen. De har imidlertid ikke tid til å fullføre det. Alt liv omkommer under eksplosjonen av øya, hvorfra bare et lite rev i havet gjenstår. Nybyggere, som overnattet i et telt ved bredden, blir kastet i sjøen av en luftbølge. Alle av dem, med unntak av Jupe, forblir i live. I mer enn ti dager har de sittet på skjæret, nesten døende av sult og ikke lenger håpet på noe. Plutselig ser de et skip. Dette er Duncan. Han redder alle. Som det senere viser seg, fløt kaptein Nemo, mens boten fremdeles var intakt, på den til Tabor og etterlot en beskjed til redningsmannskapene.

Tilbake til Amerika for smykkene donert av kaptein Nemo, kjøper venner et stort stykke land og lever på det på samme måte som de bodde på Lincoln Island.