Det er tre historielinjer i romanen: 1. - en fortelling som ble utført på vegne av engelen Agasfera, hvis navn betyr “Guds elskede”; 2 - en historie om livsfaren til Paulus von Eicen, en yngre samtid til Martin Luther; Tredje - korrespondanse mellom professor Siegfried Byfus, direktør for Institute for Scientific Atheism in East Berlin (DDR) og professor Johanaan Leuchtentrager fra Det hebraiske universitetet i Jerusalem.
De udødelige åndene Agasfer og Lucifer, skapt av Gud den første dagen, blir kastet ned fra himmelen for å nekte å bøye seg for Adam, som ble skapt for deres øyne av støvet og de fire elementene. Deres veier spriker, for Agasfer, i motsetning til Lucifer, som lengter etter fullstendig ødeleggelse av alt som er skapt, håper at verden kan endres. Fra nå av er han dømt til å streife rundt på jorden til siste dom.
Agasfer prøver å overbevise rebben Yeshua, som tror at han er Guds sønn, som har tjent Faderens kjærlighet og tjeneste, at Gud, Universets Skaper, ikke er kjærlighetens Gud. Hvis Yeshua virkelig er Guds sønn, må han endre denne verden, full av grusomhet og ikke rettferdighet. Men Yeshua nekter å kjempe med Gud og etablere sitt rike på jorden: han er overbevist om at kjærligheten er sterkere enn sverdet, klar til å bli et offer som er dømt til slakting og til å ta på seg verdens synder.
Agasfer vet alt Yeshua forventer: svik mot Juda, dom, korsfestelse, død og oppstandelse, hvoretter han vil stige opp til Gud. Men dette, som Agasfer helt sikkert vet, vil ikke endre noe i verden så klokt ordnet. Agasferus møter Lucifer, som spiller på Judas Iskariots grådighet, inspirerer ham til å forråde læreren sin, hvis han selv vil at Judas skal forråde ham. Agasfer irettesetter Yeshua for passivitet og spår at læringene etter hans død vil bli pervers og i kjærlighetens navn vil de gjøre grusomhet og urettferdighet. Forrige gang Agasfer overtaler Yeshua til å bli leder og konge av Israel, når han fører korset til Golgata og vil hvile ved portene til Agasfer hus. Agasfer skjuler Guds ildsverd under klærne, han er klar til å heve ham for den lidendes skyld og spre fiendene sine, men han vil fullstendig drikke koppen som Faderen ga ham. Agasfer, opprørt over sin iherdighet, driver Yeshua bort, og han forbanner ham og sier at fra nå av vil han, Agasfer, måtte vente til Menneskesønnen kommer tilbake.
Lucifer overbeviser Agasfera om å dra til Yeshua og spørre ham hva han oppnådde ved å ta på seg verdens synder, for verden ble ikke bedre etter hans martyrium. Agasfer krenker Menneskesønnens himmelske fred og kaller ham til regnskap, men han hevder fortsatt at sannheten er i Gud, selv om Agasfer ser at hans tro på Faderens visdom og rettferdighet rystes.
Agasfer og Yeshua la ut på jakt etter Gud. De vandrer i Sheolens vidstrakte og møter en eldgamle eldste som skriver i sanden bokstavene i Livets bok, og vinden blåser dem umiddelbart bort. Denne gamle mannen er Gud. Han har lenge vært skuffet over skapelsen sin: den lever etter sine egne lover og det er ingen måte å endre noe i denne forferdelige verden, som har blitt ugjenkjennelig selv for ham, hans Skaper. Menneskesønnen er indignert over at Faderen sendte ham til korset, og visste på forhånd at det ville være forgjeves. Menneskesønnen går i krig mot hellige grunnmur, og Armageddon, den siste slaget på jorden, begynner. Fire ryttere, kalt ild, krig, sult og død, følger Menneskesønnen, etterfulgt av horder av Gog og Magog og englene i avgrunnen, kastet ned fra himmelen på den sjette skapelsesdagen, sammen med Lucifer og Agasphere, og foran dem er et beist rundt syv hoder og ti horn, hvis navn er Antikrist.
Lucifer og Agasfer følger forberedelsene til kamp. Stjernene faller fra himmelen, åpner fontenene i avgrunnen, hele jorden brenner, folk gjemmer seg i huler og fjellkjelder, men selv der overhaler døden dem. Menneskesønnen med sin hær krysser himmelen og stiger høyere på jakt etter et nytt Jerusalem, bygget av jaspis og rent gull, men det er ingen steder å finne. Når hæren hans begynner å knurre. Menneskesønnen erklærer at Gud ble beseiret og flyktet, og fremover ble Han, Menneskesønnen, Gud og vil skape en ny himmel og en ny jord, et rike av kjærlighet og rettferdighet, der mennesket ikke vil være en fiende for mennesket. Men alle ler av de naive ordene fra Menneskesønnen: de fire rytterne, Gogi og Magogi, og alle de syv hodene til Antikrist. Lucifers helvetes latter høres, og den samme gamle mannen dukker opp som skrev Livets bok. Menneskesønnen prøver å drepe ham med et sverd, men den eldste forteller ham at Sønnen er farens likhet og er uatskillelig fra ham. Den eldste blir så enorm at alt som kan passe i hans høyre hånd og uttaler Hans navn, det hemmelige navnet på Gud. I øynene til Agasfera, som observerer denne scenen, forsvinner alt: blant den omkringliggende tomheten - bare figuren til Rebbe Yeshua, skrøpelig og utmattet. Agasfer hører en fjern latter: dette er alt som gjenstår av Lucifer, avgrunnens herre og den store jageren for orden. Agasfer og Yeshu "faller ned i avgrunnen, som både er rom og tid, og det er verken topp eller bunn, bare strømmer av partikler - ennå ikke skilt lys og mørke. Agasfer og Menneskesønnen smelter sammen i kjærlighet og blir en, og siden Gud er en med sin Sønn, da blir Agasfer en med ham: "ett vesen, en stor tanke, en drøm".
Studiosus Paulus von Eicen, som reiser til Wittenberg for å studere med Luther og Melanchthon, blir kjent med en viss Hans Leuchtentrager i gårdsplassen (betydningen av det tyske etternavnet Leuchtentrager er identisk med betydningen av navnet Lucifer: bærer lys, lysbærer), som blir hans konstante følgesvenn og verdifulle råd Eicens hele liv. Takk til hjelp fra Hans, som kjenner alle hemmelighetene til magi og trolldom; lat og kortsiktig, men ambisiøs Eicen består bestått eksamen, oppnår tillit og støtte fra Luther og blir pastor. Han gjør en karriere uten å tenke på hvorfor Hans tar seg av henne og hvilke mål han forfølger. Den mystiske skikkelsen av den evige jøde, eller Agasfera, som alltid forlater den grådige og voluptuous Eicen, en voldsom antisemitt, som den kristne religionen bare er en måte å takle motstanderne på og oppnå en sterk posisjon i samfunnet, reiser seg gjentatte ganger på livsstien til Eitsen.
Eicen arrangerer en tvist mellom kristne og jøder og inviterer den evige jøde, Agasfera, til å vitne om at Jesus var den sanne Messias og Guds sønn. Så Eicen håper å konvertere jødene til ekte tro og bli berømt i hele Tyskland. Men Agasfer håner bare Eicens dumhet og religiøse hykleri, som han utsatte ham for grusom tortur for. Agasfer, slått av sprell, dør, og Eitsen håper at han endelig ble kvitt den irriterende jøde. Mange år går, men Agasfer, så ungdommelig og hånlig som han var på det første møtet, dukker igjen opp for den gamle Eicen. Sammen med Leuchtentrager, som ikke lenger skjuler at han er Lucifer, tar bort underverdenens herre, Agasfer, bort Eicens sjel, etter å ha lest for ham ordene til profeten Esekiel og utsatt de onde hyrdene.
En professor ved det hebraiske universitetet, Johanaan Leuchtentrager, inngår korrespondanse med Siegfried Weifus og informerer ham om at han personlig kjenner Agasfer, en samtid fra Rebbe Yeshua, eller Jesus Kristus. Den militante ateisten Byfus, som innehar posisjonen som dialektisk materialisme, prøver å bevise for Leuchtentrager at dette ikke kan være, men på slutten av korrespondansen er han så fascinert av mysteriet med Agasfera at de "kompetente myndighetene" til DDR, som observerer korrespondansen til de to professorene, til slutt anbefaler Byfus svarer ikke på brev fra Israel: de er bekymret for at Leuchtentrager skal med vennen Agasfer for å komme til DDR og dermed overbevise marxisten Byfus om den virkelige eksistensen av den evige jøde, men ingen lykkes med å forhindre deres ankomst til DDR. 31. desember 1981 besøkte de Byfus ved Institute of Scientific Atheism, hvoretter han inviterte dem til hjemmet hans, der familien i mange venners krets forberedte seg til feiringen av det nye året.
Byfus er innelåst med Agasfer og Leuchtentrager på kontoret sitt, og som kona senere forteller ham, krangler de med dem i lang tid. Etter midnatt er et stort hull med forkullede kanter funnet på veggen på Byfus kontor, men verken ham selv eller hans israelske kolleger er i rommet. Under etterforskningen viser det seg at de israelske borgerne A. Agasfer og I. Leuchtentrager ikke fikk visum, og sjekkpunktene registrerte ikke deres inn- og utreise. Senere blir det kjent at natten til 31. desember 1980 til 1. januar 1981, på vakt fra vakttårnet ved grenseovergangen til Friedrichstrasse, tre uidentifiserte personer beveget seg gjennom luften. En brennende hale strakk seg for to, og de bar den tredje under armene. Krenkere av grensen fløy over grensen til DDR, hvoretter de høydet og forsvant fra syne. Men de "kompetente myndighetene" fant ut om dette mye senere, siden vakthavende ansatte ble beskyldt for å ha drukket alkohol under soning og de sonet soningen.