Helten fra romanen er seks jenteskoler, forent i "Brody-klanen" etter viljen til deres elskede lærer, frøken Gene Brody. Handlingen finner sted i Edinburgh på trettiårene. Frøken Brodie driver en liten jenteskole på en respektabel privatskole. På en av de første leksjonene i historien forteller frøken Brody i stedet for et foredrag den tragiske handlingen om hennes første kjærlighet - forloveden hennes døde i krigen en uke før våpenhvilen - som berører jentene til tårer. Så begynner klassene hennes i "Sannhet, godhet og skjønnhet," ved å bruke de mest ukonvensjonelle metodene. Hun ga seg selv opp med å oppdra barn og ga dem, i sitt eget favorittuttrykk, "fruktene av sin storhetstid."
Frøken Brodie var, i tross for ukonvensjonelle metoder, overhodet ikke en eksepsjonell hendelse, eller ikke helt i hodet. Hennes unikhet besto bare i det faktum at hun underviste ved en så konservativ utdanningsinstitusjon. På trettiårene, som frøken Brody, var det legioner: kvinner tretti og eldre som fylte sin uredde krigføring gamle liv med kraftig aktivitet innen kunst og sosial velferd, opplysning og religion. Noen var feminister og fremmet de mest avanserte ideene, andre var begrenset til deltakelse i kvinnekomiteer og kirkemøter. Imidlertid underviste kvinner i den første kategorien, selvfølgelig, på konservative skoler, der hadde de ikke et sted. Det var det frøken Brodies kolleger trodde. Men frøken Brody, omgitt av hennes utvalgte elever, Brody-klanen, forble utilgjengelig for intriger. “Uhørbar, som en stein,” beundrer beundrerne hennes når hun stolt går langs skolekorridoren til de hånlige hilsenene til de mer vanlige kollegene.
Frøken Brodie virker ekstraordinær, i det minste i skolens omgivelser. Hun er ikke vakker og ikke i det hele tatt ung, men på "sin fyrste tid" opplever hun glimt av ekte sjarm, og i slike øyeblikk er hun uvanlig god. Hun er også ekstremt attraktiv for menn og erobrer hjertene til de to eneste mannlige lærerne på skolen.
Med gløden av frøken Brody finner de første trinnene i fantastisk åndelig evolusjon sted, og endres internt og eksternt like raskt som hennes voksende elever. Mens jentene fremdeles studerer under hennes tilsyn i grunnleggende karakterer, gjør Miss Brody leksjonene matematikk, engelsk eller historie til særegne utflukter på alle områder av menneskelig kultur, fra erotikk til fascisme: hennes lidenskapelige kunstneriske natur, som ikke kjenner noen religiøse forbud, tilber begge deler, og i mellomtiden Giotto og Mary Stuart.
Gradvis, umerkelig for seg selv, vokser en risikofylt tro på sin egen syndløshet i henne; i løpet av sin storhetstid overskrider den grensene for enhver etikk og når en virkelig sjokkerende grad av umoral.
Men så langt er dens innflytelse på Brody-klanen ubegrenset. Den består av seks jenter: Monica Douglas, kjent for matematiske evner og ville utbrudd av sinne, atletiske Eunice Gardner, grasiøse Jenny Gray, langsomt klinkede Mary McGregor, Sandy Stanger med uvanlig bittesmå grisete øyne og deretter berømt for sin sexappell Rose Stanley. De vokser under den sterke åndelige påvirkningen fra frøken Brody, deres indre liv er fullstendig fylt med en analyse av observasjonene til læreren deres. En gang under en utflukt forklarer frøken Brody for jentene hva som faktisk betyr å lære for henne. Når hun utdanner barn, trekker hun frem egenskapene som ligger i dem av naturen, men hun er også pålagt å investere i barn informasjon som er fremmed for dem. Hun overbeviser "klanen" om at hver jente i oppveksten må finne og innse "hennes kall", slik hun fant henne i dem.
Frøken Brodie er på vei til toppen av sin fyrste; jenter vokser opp og utvikler seg med henne. Det ser ut til at ingen bedre enn hun kan gjette barnas sanne kall, og gjør paniske anstrengelser for å veilede jentene på den eneste rette måten, ser det ut til for henne.
Hver av "Brody-klanen" lever en individuell og unik skjebne, helt annerledes enn de kallene som ble unnfanget av frøken Brody. Hennes postume rolle i deres voksne liv er mye mer subtil og mer sammensatt.
Mer tragisk enn resten er Mary McGregor, en uanmeldt tosk for venner og frøken Brody. Hun dør klokka tre på et brennende hotell, og kort tid før hennes død, i et trist øyeblikk, bestemmer hun seg for at de lykkeligste øyeblikkene i hennes korte liv var de hun tilbrakte i selskap med frøken Brody og hennes "klan", om enn på sakte tenkende basis. Alle jenter på sin egen måte forråder idealene til frøken Brody. Kort tid før de døde av kreft, overlever mentoren deres til slutt fra skolen under påskudd av å forkynne fascisme for barn. Frøken Brodie beundret faktisk nesten naivt orden og disiplin i fascismens land sammen med monumenter og fontener. Og nå ber Sandy Stanger, hennes fortrolige, allerede på terskelen til konfirmasjonen, regissøren, frøken Brodys viktigste illesjager, om å finne feil med politiske overbevisninger og tvinge frøken Brody til å trekke seg. Sandy går den vanskeligste og selvmotsigende veien. Svik av henne fører tillit til at aktivitetene til frøken Brody til slutt er skadelige for favorittene hennes. Fakta er at frøken Brody forelsker seg i en tegningslærer, Teddy Lloyd, en stor katolikk. Når hun innser at denne kjærligheten ikke er gjennomførbar, inngår hun, som om hun til tross for seg selv, et forhold til Gordon Loiter, musikklærer. Hun elsker Teddy, men mener at en av jentene bør erstatte henne og bli hans elskerinne. Hun legger sitt hjerte og sjel i denne ville planen, i henhold til hvilken Rose Stanley, den mest feminine av jentene, skulle overgi seg til artisten i stedet. Rose er imidlertid helt likegyldig til Teddy, og Sandy blir hans elskerinne. Samtidig var og forblir frøken Brody kunstnerens sanne mus, og med forundring ser Sandy at uansett hvilke av jentene i “klanen” Teddy tegner, så opptrådte frøken Brodys funksjoner alltid i henne. Sandy, som besitter psykologens kalde, analyserende sinn, kan ikke godta mysteriet med den mystiske og kraftige innflytelsen fra den "morsomme gamle hushjelpen" på alle rundt. Det viser seg snart at en av frøken Brodies fans, som ikke tilhører "klanen", bukker under for hennes agitasjon og slipper til Spania for å kjempe på siden av fascisten Franco. Hun dør underveis i toget. Deretter gir Sandy skrekkelig Miss Brody regissøren, og hun hintet på Miss Brody. Ideen om svik undergraver Miss Brodys ukuelige ånd. Fram til sin død slutter hun aldri å pine seg selv og andre med karrige spekulasjoner. Faktisk ser det ut til at Sandy, hele "klanen" forråder frøken Brody og gir avkall på "oppfordringene." Frøken Brody så i jentene sine "instinkt og innsikt", som var verdige et fullstendig og pulserende liv. Sandy drar etter svik, til klosteret, der hun er ulykkelig og skuffet. Rose Stanley blir en dydig kone, selv om hun har en ny Venus, "en stor kjæreste," ifølge frøken Brody. Men de føler alle at de har lurt seg selv.
Gjennom årene med vennskap med frøken Brody, er de så gjennomsyret av hennes tro at de skaffer seg en indre åndelig likhet med henne, som kunstneren Teddy Lloyd korrekt fanget i maleriene sine.
