Den lyriske romanen - forfatterens største verk - er skrevet i epistolær form. Navnet på hovedpersonen - Hyperion - refererer til bildet av titanen, faren til solguden Helios, hvis mytologiske navn betyr høyresittende. Det ser ut til at handlingen til romanen, som er en slags "åndelig odyssey" av helten, foregår ut av tiden, selv om scenen for hendelsene er Hellas i andre halvdel av 1700-tallet, som er under det tyrkiske åket (dette indikeres av referanser til oppstanden i havet og slaget ved Chesme i 1770).
Etter rettssakene som falt for hans parti, forlot Hyperion deltakelse i kampen for Hellas uavhengighet, han mistet håpet om den forestående frigjøringen av hjemlandet, anerkjenner hans maktesløshet i det moderne liv. Fra nå av valgte han løsningen for seg selv. Etter å ha muligheten til å vende tilbake til Hellas igjen, bosetter Hyperion seg på Isthmus of Corinth, hvor han skriver brev til sin venn Bellarmin, som bor i Tyskland.
Det ser ut til at Hyperion oppnådde den ønskede, men kontemplative eremitasjen heller ikke gir tilfredshet, naturen åpner ikke lenger armene for ham, han, alltid ivrig etter å slå seg sammen med henne, plutselig føler seg en fremmed, forstår henne ikke. Det ser ut til at han ikke er bestemt til å finne harmoni verken i seg selv eller utenfor.
Som svar på Bellarmins forespørsler, skriver Hyperion til ham om barndommen hans tilbrakte på øya Tinos, datidens drømmer og håp. Han avslører den indre verden av en rikt begavet tenåring, uvanlig følsom for skjønnhet og poesi.
Læreren Adamas utøver en enorm innflytelse på dannelsen av den unge manns synspunkter. Hyperion lever i dagene med bitter tilbakegang og nasjonal slaveri av landet sitt. Adamas innrømmer eleven en følelse av beundring for den eldgamle æra, besøker de fantastiske ruinene av tidligere herlighet sammen med ham, snakker om tapperheten og visdommen til hans store forfedre. Hyperion opplever et vanskelig samliv med sin elskede mentor.
Full av åndelig styrke og høye impulser, overlater Hyperion til Smyrna å studere militære anliggender og navigasjon. Han er løftet, lengter etter skjønnhet og rettferdighet, han møter stadig menneskelig dobbelt ansikt og kommer i fortvilelse. En virkelig suksess er et møte med Alabanda, der han finner en nær venn. Unge menn gleder seg over ungdom, håper på fremtiden, de er samlet av den høye ideen om å frigjøre hjemlandet, fordi de bor i et skjelt land og ikke kan forene seg med dette. Deres synspunkter og interesser er stort sett nærme, de har ikke til hensikt å være som slaver som vanlige unner seg en søt smekk, de blir overveldet av en tørst etter å handle. Det er her avviket blir avslørt. Alabanda - en mann med praktisk handling og heroiske impulser - forfølger stadig tanken om behovet for å "sprenge råtne stubber." Hyperion insisterer imidlertid på at det er nødvendig å utdanne mennesker under tegnet "teokrati av skjønnhet." Alabanda kaller slike resonnement tomme fantasier, venner krangel og en del.
Hyperion opplever nok en krise, han er på vei hjem, men verden rundt er bleket, han drar til Calavria, der kommunikasjonen med skjønnhetene i middelhavsnaturen igjen vekker ham til liv.
Notars venn bringer ham til samme hus, der han møter sin kjærlighet. Diomita virker for ham guddommelig-vakker, han ser i henne en uvanlig harmonisk natur. Kjærligheten forener sjelene deres. Jenta er overbevist om det høye kallet til hennes utvalgte - å være "lærer av folket" og lede kampen for patriotene. Likevel er Diomita mot vold, selv for å opprette en fri stat. Og Hyperion nyter lykken som har kommet til ham, fått ro i sinnet, men han forutser den tragiske frigjøringen av idyllen.
Han mottar et brev fra Alabanda med en melding om den kommende talen til de greske patriotene. Etter å ha sagt farvel til sin elsker, skynder han seg å bli med i krigernes rekker for frigjøring av Hellas. Han er full av håp om seier, men er beseiret. Årsaken er ikke bare maktesløsheten før tyrkenes militærmakt, men også uenigheten med dem rundt seg, sammenstøtet mellom ideal og hverdagsliv virkelighet: Hyperion føler umuligheten av å plante paradis ved hjelp av et band med ranere - soldater fra frigjøringshæren utfører ran og massakrer, og ingenting kan holdes tilbake.
Etter å ha bestemt at han ikke har noe mer til felles med sine landsmenn, går Hyperion inn i tjenesten i den russiske flåten. Fra nå av venter skjebnen til eksil ham, til og med hans egen far forbannet ham. Frustrert, moralsk plaget søker han død i Chesme Sea-slaget, men forblir i live.
Når han trekker seg, har han til hensikt å endelig rolig lege med Diomita et sted i Alpene eller Pyreneene, men han får nyheter om hennes død og forblir utrøstelig.
Etter mange vandringer havner Hyperion i Tyskland, hvor han bor en god stund. Men reaksjonen og tilbakeblikkene som hersker der synes han kveler, i et brev til en venn snakker han forsiktig om falskheten i en døende offentlig orden, tyskernes mangel på borgerlige følelser, småaktige ønsker, forsoning med virkeligheten.
En gang spådde læreren Adamas overfor Hyperion at slike natur som ham er dømt til ensomhet, vandrende, til evig misnøye med seg selv.
Og Hellas er beseiret. Diomita er død. Hyperion bor i en hytte på øya Salamis, sorterer gjennom minner fra fortiden, sørger over tap, umulighetene av idealer, prøver å overvinne indre uenighet, opplever en bitter følelse av melankoli. Det ser ut til at han tilbakebetalte den svarte utakknemligheten til moder jord og forsømmer livet og alle kjærlighetsgavene som hun kastet bort. Hans skjebne er kontemplasjon og filosofisering, som før han forblir tro mot den panteistiske ideen om forholdet mellom menneske og natur.